Rencontre « Cycle de vie des images en microscopie : les enjeux techniques »

Coupe de muguet observée en fluorescence en microscopie confocale par mosaiquage; Credit:MicroPicell Nantes, CNRS UMS 3556 INSERM UMS 16 La Mission pour l'Interdisciplinarité du CNRS et les réseaux CALCUL, DEVLOG, RBDD, RCCM, REMISOL, RTMFM organisent le 15/12/2015 de 9h30 à 17h30 à Paris une journée d'exposés et de rencontres autour du traitement d'images en microscopie.

Cette journée traitera de l'ensemble du cycle de vie des images, au vu des évolutions techniques majeures récentes. En effet, le travail aux interfaces entre différentes disciplines est une des clefs pour lever les verrous technologiques.

Webcast

Ces journées ont été web-diffusées, un grand merci à Olivier Drevon pour son travail en conditions extrêmes !

Thèmes abordés

Les 4 thèmes suivants seront abordés :

  • T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'information, gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul
  • T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer, valider, diffuser ? 
  • T3 - Infrastructures de calcul  et de stockage adaptées aux données images de microscopie
  • T4 - Outils et méthodes d'enrichissement sémantique des images (quels standards de métadonnées et/ou ontologies pour le partage, l’indexation/le référencement de l’information ?)

Programme des interventions

Par défaut les interventions prendront la forme de 15 minutes d'exposé + 5 minutes de questions, afin de favoriser les discussions tout au long de la journée.



Début des exposés : 9h30

  • 9h30 - 10h15 : Exposé d'ouverture : Marc Baaden, Institut de Biologie Physico-Chimique, Paris. Au coeur des molécules - du calcul intensif au calcul intuitif


  • 10h15 - 10h40 : Pause Café


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  • 12h20 - 13h45 : Repas






  • 15h05 - 15h30 : Pause Café




  • 16h10 - 17h30 : Session Inter-disciplinaire et table ronde
    • 16h10 : René Doursat, Laboratoire BioEmergences, CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette: Multiscale in vivo imaging for the multilevel modeling of morphogenetic processes
    • 16h30 : Table ronde. Actions communes et transverses issues de ces journées.


Inscriptions

Les inscriptions sont terminées (8/12/2015)

Informations pratiques

Lieu : Amphi Charpak Jussieu Paris – voir plan d’accès
Horaire : de 9h30 à 17h30

Ces journées seront web-diffusées

Comité de programme et d'organisation

Perrine Paul-Gilloteaux, Romaric David, Florent Langrognet, Christine Plumejeaud, Damien Schapman, Fabrice Richard, David Albertini, Suzanne Bolte, Vanessa Tocut.

public/index.txt · Dernière modification: 2015/12/31 15:32 par david@unistra.fr