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public:index [2015/12/14 18:38] perrine.paul-gilloteaux@univ-nantes.fr |
public:index [2015/12/14 21:30] david@unistra.fr |
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===== Thèmes abordés ===== | ===== Thèmes abordés ===== | ||
Les 4 thèmes suivants seront abordés : | Les 4 thèmes suivants seront abordés : | ||
- | * T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'information, gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul | + | * T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'information, gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul |
* T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer, valider, diffuser ? | * T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer, valider, diffuser ? | ||
* T3 - Infrastructures de calcul et de stockage adaptées aux données images de microscopie | * T3 - Infrastructures de calcul et de stockage adaptées aux données images de microscopie | ||
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* 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel** | * 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel** | ||
- | * 10h40 : Thierry Pecot, Inria Rennes. Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle. | + | * 10h40 : Thierry Pecot, Inria Rennes. [[public:pecot|Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle.]] |
- | * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. Le guichet d'analyse d'images de Biogenouest | + | * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. [[public:prigent|Le guichet d'analyse d'images de Biogenouest]] |
- | * 11h20 : Thierry Savy, Laboratoire BioEmergences, CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette. Visualisation interactive 3D+temps | + | * 11h20 : Dimitri Fabrèges, Laboratoire BioEmergences, CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette. [[public:fabreges|Visualisation interactive 3D+temps |
+ | ]] | ||
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* 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. [[public:maree|Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data]] | * 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. [[public:maree|Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data]] | ||
* 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. [[public:gaignard|SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique]] | * 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. [[public:gaignard|SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique]] | ||
- | * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : 3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool | + | * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : [[public:gilles|3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool]] |
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* 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1** | * 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1** | ||
- | * 14h45 : Michel Smadja, Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie. | + | * 14h45 : Michel Smadja, [[public:smadja|Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie.]] |
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* 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2** | * 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2** | ||
- | * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : Un cas d'étude concernant l'architecture des bases de données images, "CiD-iManage" | + | * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : [[public:salamero|Un cas d'étude concernant l'architecture des bases de données images, "CiD-iManage"]] |
* 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : [[public:michalon|Environnement informatique d'imagerie microscopique en biologie structurale à l'IGBMC]] | * 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : [[public:michalon|Environnement informatique d'imagerie microscopique en biologie structurale à l'IGBMC]] | ||