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public:index [2015/12/08 10:39]
florent.langrognet@univ-fcomte.fr
public:index [2015/12/31 15:32] (Version actuelle)
david@unistra.fr
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 Cette journée traitera de l'​ensemble du cycle de vie des images, au vu des évolutions techniques majeures récentes. ​ Cette journée traitera de l'​ensemble du cycle de vie des images, au vu des évolutions techniques majeures récentes. ​
 En effet, le travail aux interfaces entre différentes disciplines est une des clefs pour lever les verrous technologiques. En effet, le travail aux interfaces entre différentes disciplines est une des clefs pour lever les verrous technologiques.
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 +====== Webcast ======
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 +[[http://​webcast.in2p3.fr/​live/​cycle_de_vie_des_images_en_microscopie|Ces journées ont été web-diffusées]],​ un grand merci à Olivier Drevon pour son travail en conditions extrêmes !
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 ===== Thèmes abordés ===== ===== Thèmes abordés =====
 Les 4 thèmes suivants seront abordés : Les 4 thèmes suivants seront abordés :
-  * T1 -  Workflow de traitements sur big data : extraction d'​information,​ gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul+  * T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'​information,​ gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul
   * T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer,​ valider, diffuser ?    * T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer,​ valider, diffuser ? 
   * T3 - Infrastructures de calcul  et de stockage adaptées aux données images de microscopie   * T3 - Infrastructures de calcul  et de stockage adaptées aux données images de microscopie
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   * 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel**   * 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel**
-    * 10h40 : Thierry Pecot, Inria. Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle. +    * 10h40 : Thierry Pecot, Inria Rennes[[public:​pecot|Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle.]] 
-    * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. Le guichet d'​analyse d'​images de Biogenouest +    * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. ​[[public:​prigent|Le guichet d'​analyse d'​images de Biogenouest]] 
-    * 11h20 : Thierry SavyBioemergences, Gif-Sur-Yvette. Visualisation interactive 3D+temps +    * 11h20 : Dimitri FabrègesLaboratoire BioEmergences,​ CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette. ​[[public:​fabreges|Visualisation interactive 3D+temps 
 +]]
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   * 11h40 - 12h20 : **Session Workflow** et **présentation des réseaux** ​   * 11h40 - 12h20 : **Session Workflow** et **présentation des réseaux** ​
-    * 11h40 : Daniel Racoceanu, Université Pierre et Marie Curie, Massive data in Digital Patholgy:​ insights about semantics/​micro-semiology and scalable imaging methods.+    * 11h40 : Daniel Racoceanu, Université Pierre et Marie Curie, ​[[public:​racoceanu|Massive data in Digital Patholgy:​ insights about semantics/​micro-semiology and scalable imaging methods.]]
     * 12h00 : Groupe de travail Traitement d'​images en Microscopie : Présentation des réseaux ayant organisé ces journées.     * 12h00 : Groupe de travail Traitement d'​images en Microscopie : Présentation des réseaux ayant organisé ces journées.
  
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   * 13h45 - 14h45 : **Session Sémantique**   * 13h45 - 14h45 : **Session Sémantique**
-    * 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data +    * 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. ​[[public:​maree|Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data]] 
-    * 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique +    * 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. ​[[public:​gaignard|SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique]] 
-    * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : 3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool+    * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : [[public:​gilles|3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool]]
  
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    * 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1**    * 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1**
-     * 14h45 : Michel Smadja, Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie.+     * 14h45 : Michel Smadja, ​[[public:​smadja|Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie.]]
  
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    * 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2**    * 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2**
-     * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : Un cas d'​étude concernant l'​architecture des bases de données images, "​CiD-iManage"​ +     * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : [[public:​salamero|Un cas d'​étude concernant l'​architecture des bases de données images, "​CiD-iManage"​]] 
-     * 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : Environnement informatique d'​imagerie microscopique en biologie structurale à l'​IGBMC+     * 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : [[public:​michalon|Environnement informatique d'​imagerie microscopique en biologie structurale à l'​IGBMC]]
  
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    * 16h10 - 17h30 : ** Session Inter-disciplinaire et table ronde **    * 16h10 - 17h30 : ** Session Inter-disciplinaire et table ronde **
-       * 16h10 : René Doursat, ​Institut de des Neuro-Sciences Paris-Saclay, ​Multiscale in vivo imaging for the multilevel modeling of morphogenetic processes: data management and data analysis ​+       * 16h10 : René Doursat, ​Laboratoire BioEmergences,​ CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette: ​Multiscale in vivo imaging for the multilevel modeling of morphogenetic processes ​
        * 16h30 : Table ronde. Actions communes et transverses issues de ces journées.        * 16h30 : Table ronde. Actions communes et transverses issues de ces journées.
  
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 ==== Comité de programme et d'​organisation ==== ==== Comité de programme et d'​organisation ====
-Perrine Paul-Gilloteaux, ​[[public:​abstracts#​Test Abstract|Romaric David]], Florent Langrognet, Christine Plumejeaud, Damien Schapman, ​ Fabrice Richard, David Albertini, Suzanne Bolte, Vanessa Tocut.+Perrine Paul-Gilloteaux,​ Romaric David, Florent Langrognet, Christine Plumejeaud, Damien Schapman, ​ Fabrice Richard, David Albertini, Suzanne Bolte, Vanessa Tocut.
public/index.1449567582.txt.gz · Dernière modification: 2015/12/08 10:39 par florent.langrognet@univ-fcomte.fr