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Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
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public:index [2015/12/08 10:39] florent.langrognet@univ-fcomte.fr |
public:index [2015/12/31 15:32] (Version actuelle) david@unistra.fr |
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| Cette journée traitera de l'ensemble du cycle de vie des images, au vu des évolutions techniques majeures récentes. | Cette journée traitera de l'ensemble du cycle de vie des images, au vu des évolutions techniques majeures récentes. | ||
| En effet, le travail aux interfaces entre différentes disciplines est une des clefs pour lever les verrous technologiques. | En effet, le travail aux interfaces entre différentes disciplines est une des clefs pour lever les verrous technologiques. | ||
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| + | ====== Webcast ====== | ||
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| + | [[http://webcast.in2p3.fr/live/cycle_de_vie_des_images_en_microscopie|Ces journées ont été web-diffusées]], un grand merci à Olivier Drevon pour son travail en conditions extrêmes ! | ||
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| ===== Thèmes abordés ===== | ===== Thèmes abordés ===== | ||
| Les 4 thèmes suivants seront abordés : | Les 4 thèmes suivants seront abordés : | ||
| - | * T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'information, gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul | + | * T1 - Workflow de traitements sur big data : extraction d'information, gestion de flux de tâches, fouille de données, codes de calcul |
| * T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer, valider, diffuser ? | * T2 - Génie logiciel: Quel logiciel (développement sur mesure ou utilisation de solutions existantes) ? Comment développer, valider, diffuser ? | ||
| * T3 - Infrastructures de calcul et de stockage adaptées aux données images de microscopie | * T3 - Infrastructures de calcul et de stockage adaptées aux données images de microscopie | ||
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| * 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel** | * 10h40 - 12h00 : **Session Génie Logiciel** | ||
| - | * 10h40 : Thierry Pecot, Inria. Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle. | + | * 10h40 : Thierry Pecot, Inria Rennes. [[public:pecot|Mobyle@SERPICO : Méthodes d’analyse d’image sur un portail web Mobyle.]] |
| - | * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. Le guichet d'analyse d'images de Biogenouest | + | * 11h00 : Sylvain Prigent, Université de Rennes. [[public:prigent|Le guichet d'analyse d'images de Biogenouest]] |
| - | * 11h20 : Thierry Savy, Bioemergences, Gif-Sur-Yvette. Visualisation interactive 3D+temps | + | * 11h20 : Dimitri Fabrèges, Laboratoire BioEmergences, CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette. [[public:fabreges|Visualisation interactive 3D+temps |
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| * 11h40 - 12h20 : **Session Workflow** et **présentation des réseaux** | * 11h40 - 12h20 : **Session Workflow** et **présentation des réseaux** | ||
| - | * 11h40 : Daniel Racoceanu, Université Pierre et Marie Curie, Massive data in Digital Patholgy: insights about semantics/micro-semiology and scalable imaging methods. | + | * 11h40 : Daniel Racoceanu, Université Pierre et Marie Curie, [[public:racoceanu|Massive data in Digital Patholgy: insights about semantics/micro-semiology and scalable imaging methods.]] |
| * 12h00 : Groupe de travail Traitement d'images en Microscopie : Présentation des réseaux ayant organisé ces journées. | * 12h00 : Groupe de travail Traitement d'images en Microscopie : Présentation des réseaux ayant organisé ces journées. | ||
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| * 13h45 - 14h45 : **Session Sémantique** | * 13h45 - 14h45 : **Session Sémantique** | ||
| - | * 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data | + | * 13h45 : Raphael Maree, Université de Liège. [[public:maree|Cytomine for semantic analysis of large-scale bioimaging data]] |
| - | * 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique | + | * 14h05 : Alban Gaignard, Université de Nantes. [[public:gaignard|SyMeTRIC, vers un environnement virtuel de recherche multi-sites dédié à la médecine systémique]] |
| - | * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : 3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool | + | * 14h25 : Jean-francois Gilles, Université Pierre et Marie Curie : [[public:gilles|3D Distance analysis & colocalisation with DiAna, a novel ImageJ based tool]] |
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| * 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1** | * 14h45 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 1** | ||
| - | * 14h45 : Michel Smadja, Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie. | + | * 14h45 : Michel Smadja, [[public:smadja|Infrastructure simplifiant les développements et le déploiement d’algorithmes d’imagerie.]] |
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| * 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2** | * 15h30 - 16h10 : **Session Infrastructures - Partie 2** | ||
| - | * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : Un cas d'étude concernant l'architecture des bases de données images, "CiD-iManage" | + | * 15h30 : Jean Salamero, Institut Curie, Paris : [[public:salamero|Un cas d'étude concernant l'architecture des bases de données images, "CiD-iManage"]] |
| - | * 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : Environnement informatique d'imagerie microscopique en biologie structurale à l'IGBMC | + | * 15h50 : Jonathan Michalon, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg : [[public:michalon|Environnement informatique d'imagerie microscopique en biologie structurale à l'IGBMC]] |
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| * 16h10 - 17h30 : ** Session Inter-disciplinaire et table ronde ** | * 16h10 - 17h30 : ** Session Inter-disciplinaire et table ronde ** | ||
| - | * 16h10 : René Doursat, Institut de des Neuro-Sciences Paris-Saclay, Multiscale in vivo imaging for the multilevel modeling of morphogenetic processes: data management and data analysis | + | * 16h10 : René Doursat, Laboratoire BioEmergences, CNRS USR3695, Gif-sur-Yvette: Multiscale in vivo imaging for the multilevel modeling of morphogenetic processes |
| * 16h30 : Table ronde. Actions communes et transverses issues de ces journées. | * 16h30 : Table ronde. Actions communes et transverses issues de ces journées. | ||
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| ==== Comité de programme et d'organisation ==== | ==== Comité de programme et d'organisation ==== | ||
| - | Perrine Paul-Gilloteaux, [[public:abstracts#Test Abstract|Romaric David]], Florent Langrognet, Christine Plumejeaud, Damien Schapman, Fabrice Richard, David Albertini, Suzanne Bolte, Vanessa Tocut. | + | Perrine Paul-Gilloteaux, Romaric David, Florent Langrognet, Christine Plumejeaud, Damien Schapman, Fabrice Richard, David Albertini, Suzanne Bolte, Vanessa Tocut. |
public/index.1449567582.txt.gz · Dernière modification: 2015/12/08 10:39 par florent.langrognet@univ-fcomte.fr
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