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Cytomine (http://www.cytomine.be/) est une application internet riche pour la visualisation à distance de grandes images (à la Google Maps), l'annotation sémantique et collaborative de régions d'intérêt à l'aide d'ontologies, et leur analyse semi-automatique. Dans cet exposé nous présenterons nos choix de conception et nos modèles sémantiques de données qui permettent à des “data scientists” et des développeurs d'algorithmes d'analyse d'images d'utiliser et étendre la plateforme de multiples façons. En particulier, nous décrirons les principes d'annotation sémantique d'images à partir de vocabulaire définis par les utilisateurs, l'importation et exportation des données via des services web et une interface RESTful, et nos flux de traitement basé sur l'apprentissage supervisé et des outils de correction des prédictions d'algorithmes de classification d'objets, de segmentation sémantique d'images, de recherche visuelle par le contenu, et de détection de points d'intérêt. Nous présenterons les dernières applications de notre logiciel tel qu'il est actuellement utilisé par des groupes de recherche en biologie et biomédecine dans le domaine du cancer (poumon, sein,…), des maladies rénales, de la toxicologie et du développement (voir notre liste de publications sur http:www.cytomine.be/#publications).

public/maree.txt · Dernière modification: 2016/01/07 17:16 par david@unistra.fr