Créé début 2015, le guichet d'analyse d'images de Biogenouest vise à mutualiser les compétences et outils d'analyse d'images du réseau des plate-formes d'imagerie du Grand Ouest. Ce guichet est une structure de proximité qui vise à accompagner les chercheurs en biologie pour la mise en place d'outils d'analyse d'images dédiés à leurs problématiques de recherche par du conseil, du développement et de la mise à disposition d'outils dédiés, des formations et ateliers ainsi que de la veille technologique visant à initier et accompagner des collaborations entre chercheurs en biologie et chercheurs en traitement d'images pour les projets complexes.

Le champ d'action du guichet d'analyse d'images est large et comprend entre autre les problématiques de microscopie photonique, de microscopie électronique, de coupes histologiques, ou encore de photographies standard. Parmi les outils mis en place à la demande d'utilisateurs, nous pouvons citer l'analyse de densité tissulaire, l'analyse de réseau neuronal, la quantification surfacique de marquage, le comptage et la localisation d'amas de marquage, le recalage de coupes sériés, la segmentation supervisée de textures tissulaires, le suivi d'objets…

Le but du guichet est maintenant de concrétiser la mutualisation du savoir et des outils à travers un portail collaboratif BIOSE (Environnement “Open Source” pour la Bio-Imagerie), contenant des cours et outils dédiés à l'analyse d'images pour la biologie, ainsi que toute l'actualité du guichet : formations, permanences, tables rondes…

public/prigent.txt · Dernière modification: 2015/12/14 18:53 par perrine.paul-gilloteaux@univ-nantes.fr